"Rådata"- eller rådatafilen gemmer alle resultaterne af de genetiske markører, der er inkluderet i vores genotypechip, som er målt i laboratoriet. Det er vigtigt at forstå, at af al denne enorme rå læsning er det kun et udvalg af markører, der analyseres og valideres individuelt for at danne de visuelle rapporter fra Koko Genetics-platformen.
Du kan nemt downloade denne fil ved at få adgang til din private konto i Indstillinger > Raw Data-stien. Når den er downloadet, giver den dig mulighed for nemt at søge efter resultatet af specifikke markører (enten ved deres RS-identifikationsnummer eller ved deres position i genomet) og uploade det til andre genetiske fortolkningsplatforme. Du skal dog huske på, at disse rådata kun er givet til informationsformål og aldrig bør bruges til medicinsk eller diagnostisk brug uden råd fra en veterinær.
Når du åbner dokumentet, vil du se den biologiske information fordelt i flere tekniske kolonner. Nedenfor forklarer vi, hvordan man fortolker hver af dem:
-
ID (identifikator): Det refererer til ID'et for de prober, der findes i vores teknologiske array (Axiom™ Canine HD Array). Varianterne analyseret i dette afsnit svarer til enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP) og små genetiske insertioner eller deletioner.
-
Kromosom: Det angiver det nøjagtige antal af kromosomet, hvorpå den genetiske variant er placeret. Hunde har 38 par autosomale kromosomer (angivet med et tal fra 1 til 38). Kønskromosomerne er navngivet med tallene 39 og 40, mens markørerne i mitokondrie-DNAet er opført med tallet 42.
-
Stilling: Det afspejler den nøjagtige placering af den genetiske markør baseret på vores referencegenom, CanFam 3.1.
-
Genotype: Denne kolonne indeholder dit kæledyrs genotyperesultater for hver markør. Genotyper er vist som parvise kombinationer af de fire DNA-nukleotider: A, T, G og C. Genetiske indsættelser er repræsenteret med bogstavet I og deletioner med D. Hvis genotypen af en bestemt markør af en eller anden teknisk grund ikke kunne bestemmes, vil '–'-symbolet fremkomme. Al denne læsning er orienteret i Plus ifølge CanFam 3.1 referencegenomet fra National Center for Biotechnology Information (NCBI).