Todos los usuarios del test de ADN de Koko Genetics tienen a su disposición el fichero Raw Data (o datos crudos) de su mascota. Se trata de un archivo muy valioso que contiene la información genética totalmente en bruto, tal y como se genera en nuestro laboratorio a partir del ADN extraído de la muestra de saliva.
A diferencia de los informes visuales que encuentras en tu plataforma, esta lectura pura no ha pasado aún por el control de calidad bioinformático que filtra qué variantes se muestran en los análisis finales. En su lugar, incluye un listado completo con las decenas de miles de marcadores genéticos presentes en el array de genotipado, los nucleótidos que posee tu mascota y su posición exacta en el genoma.
Para acceder a tu archivo y sacarle el máximo partido, solo debes tener en cuenta los siguientes pasos y detalles técnicos:
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Ruta de descarga: Puedes obtener tus datos crudos entrando en tu cuenta de Koko Genetics y dirigiéndote a Área privada > Ajustes > Raw Data.
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Formato del archivo: Debido a la inmensa cantidad de información genética que contiene, la plataforma generará un archivo comprimido en formato .zip. Solo tienes que descomprimirlo en tu ordenador para acceder al documento final, el cual se abrirá en formato .csv o .txt.
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Cómo leer el documento: Al abrir el archivo, verás la información organizada en columnas. La tercera columna te indica la posición concreta en el cromosoma donde se encuentra ese marcador (o el ID de la sonda). Por su parte, la última columna te muestra el genotipo de tu mascota para cada marcador, compuesto siempre por dos alelos (ya que los mamíferos tienen dos copias de cada cromosoma).
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Utilidad de los datos: Puedes usar este archivo Raw Data para comprobar por ti mismo el genotipo de tu mascota para cualquier marcador específico presente en nuestro chip. Además, al ser un formato estándar, te permite exportar e introducir estos datos en plataformas genéticas externas que acepten ficheros crudos.