ファイルは列で構成されています。犬の場合：
- ID：Thermo Fisher ScientificのAxiomチップの各プローブの識別子です。各プローブはSNPまたは小さな挿入・欠失を解析します。
- 染色体：犬の常染色体は38対で、1～38と表します。性染色体は39（X）と40（Y）、ミトコンドリアDNAのマーカーは42です。
- 位置：Broad Instituteが作成し、米国National Center for Biotechnology Information（NCBI）で公開されているCanFam 3.1参照ゲノム上の位置です。
- 遺伝子型：そのマーカーの2つのコピーに対応する文字（アレル）で、A、C、G、Tのいずれかです。挿入はI、欠失はDで示します。雄のX・Y染色体は各1コピーで、ミトコンドリアDNAは1つの値で表しますが、ファイル上では文字が重複して表示されることがあります。読めなかったマーカーはハイフン（-）です。遺伝子型は参照ゲノムのプラス（+）鎖に対して表記します。
猫も同じ構造ですが、猫の染色体と参照ゲノムを使用します。