Hva er kjæledyrets rådatafil, hvordan lastes den ned og hva er den til?

Alle brukere av Koko Genetics DNA-test har kjæledyrets rådatafil til disposisjon. Dette er en svært verdifull fil som inneholder fullstendig rå genetisk informasjon, generert i laboratoriet vårt fra DNA-et som er ekstrahert fra spyttprøven.

I motsetning til de visuelle rapportene du finner på plattformen din, har denne rene lesningen ennå ikke gått gjennom bioinformatikk kvalitetskontroll som filtrerer hvilke varianter som vises i de endelige analysene. I stedet inkluderer den en fullstendig liste over titusenvis av genetiske markører som er tilstede i genotyping-arrayen, nukleotidene kjæledyret ditt har og deres nøyaktige posisjon i genomet.

For å få tilgang til filen din og få mest mulig ut av den, må du bare ta hensyn til følgende trinn og tekniske detaljer:

  • Last ned bane: Du kan få rådataene dine ved å logge på Koko Genetics-kontoen din og gå til Privat område > Innstillinger > Rådata.

  • Filformat: På grunn av den enorme mengden genetisk informasjon den inneholder, vil plattformen generere en komprimert fil i .zip-format. Du trenger bare å pakke den ut på datamaskinen for å få tilgang til det endelige dokumentet, som åpnes i .csv- eller .txt-format.

  • Slik leser du dokumentet: Når du åpner filen, vil du se informasjonen organisert i kolonner. Den tredje kolonnen forteller deg den spesifikke posisjonen på kromosomet der markøren (eller probe-ID-en) er plassert. Den siste kolonnen viser deg kjæledyrets genotype for hver markør, som alltid består av to alleler (siden pattedyr har to kopier av hvert kromosom).

  • Datanytte: Du kan bruke denne rådatafilen til å sjekke kjæledyrets genotype for deg selv for en spesifikk markør som finnes på brikken vår. Videre, siden det er et standardformat, lar det deg eksportere og legge inn disse dataene til eksterne genetiske plattformer som aksepterer råfiler.