«Rådata» eller Raw Data-filen lagrer alle resultatene av de genetiske markørene som er inkludert i vår genotyping-brikke som måles i laboratoriet. Det er viktig å forstå at av all denne enorme rå lesningen, er det kun et utvalg markører som analyseres og valideres individuelt for å danne de visuelle rapportene til Koko Genetics-plattformen.
Du kan enkelt laste ned denne filen ved å gå til din private konto i Innstillinger > Raw Data-banen. Når den er lastet ned, lar den deg enkelt søke etter resultatet av spesifikke markører (enten ved deres RS-identifikasjonsnummer eller ved deres plassering i genomet) og laste det opp til andre genetiske tolkningsplattformer. Du bør imidlertid huske på at disse rådataene kun er gitt for informasjonsformål og bør aldri brukes til medisinsk eller diagnostisk bruk uten råd fra en veterinær.
Når du åpner dokumentet vil du se den biologiske informasjonen fordelt i flere tekniske kolonner. Nedenfor forklarer vi hvordan du tolker hver av dem:
-
ID (identifikator): Det refererer til ID-en til probene som finnes i vår teknologiske array (Axiom™ Canine HD Array). Variantene analysert i denne delen tilsvarer enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP) og små genetiske innsettinger eller delesjoner.
-
Kromosom: Den angir det nøyaktige antallet kromosomer som den genetiske varianten befinner seg på. Hunder har 38 par autosomale kromosomer (angitt med et tall fra 1 til 38). Kjønnskromosomene er navngitt med tallene 39 og 40, mens markørene i mitokondrie-DNAet er oppført med tallet 42.
-
Posisjon: Den gjenspeiler den nøyaktige plasseringen av den genetiske markøren basert på vårt referansegenom, CanFam 3.1.
-
Genotype: Denne kolonnen inneholder kjæledyrets genotyperesultater for hver markør. Genotyper vises som parvise kombinasjoner av de fire DNA-nukleotidene: A, T, G og C. Genetiske innsettinger er representert med bokstaven I og slettinger med D. Hvis genotypen til en bestemt markør av en eller annen teknisk grunn ikke kunne bestemmes, vil '–'-symbolet vises. All denne lesingen er orientert i Plus i henhold til CanFam 3.1 referansegenomet, fra National Center for Biotechnology Information (NCBI).