Qu'est-ce que le Raw Data de Koko Genetics ? Découvre ce que contient le fichier d'ADN brut de ton animal, à quoi il sert et comment le télécharger gratuitement dès aujourd'hui.
Lorsque tu reçois les résultats de Koko Genetics, tu vois un rapport magnifique, facile à comprendre et plein de curiosités sur la race, les traits et la santé de ta boule de poils. Mais, savais-tu que derrière ce rapport se cache une immense base de données ?
Chez Koko Genetics, nous croyons que l'information génétique de ton animal t'appartient. C'est pourquoi nous mettons à ta disposition le Raw Data : le fichier original et non traité qui sort directement de notre laboratoire.
Qu'est-ce qu'exactement un Raw Data génétique ?
Le Raw Data pour chiens et chats est un fichier numérique qui contient la lecture complète du génotypage de ton animal. Imagine-le comme le « négatif » d'une photographie ou les ingrédients bruts avant de cuisiner le plat final.
Ce fichier inclut l'information de tous les marqueurs génétiques présents sur la puce (array) que nous utilisons en laboratoire, et pas seulement ceux qui apparaissent dans ton rapport de résultats. Nous parlons d'une lecture massive de nucléotides (les lettres de l'ADN) telles que notre technologie les détecte. Étant des données « brutes », elles ne sont pas passées par le filtre d'interprétation ni le contrôle de qualité spécifique que nous appliquons pour générer les rapports de santé et de traits. C'est une information purement technique.
Quelles informations contient ce fichier ?
En téléchargeant ton Raw Data, tu obtiendras un fichier au format .csv (compressé dans un .zip en raison de sa grande taille) avec plus de dizaines de milliers de marqueurs. Chaque ligne représente un point spécifique du génome de ton animal.
Pour que tu puisses l'interpréter comme un expert, voici le guide pour comprendre les colonnes de ton fichier :
- ID (Probe ID) : C'est l'identifiant de la sonde sur notre puce (Axiom Koko Array). C'est comme le « nom technique » de ce marqueur.
- Chromosome : Il indique où se trouve cette variante génétique.
- Position : L'endroit exact dans le chromosome où se trouve le marqueur. Pour cela, nous utilisons comme carte le génome de référence CanFam 3.1 (le standard scientifique actuel) pour les chiens, et Felis catus_9.0 pour les chats.
- Génotype : C'est ici qu'est le vif du sujet. Tu verras des combinaisons de deux lettres (allèles) qui peuvent être A, T, G, C.
- Si tu vois un I ou un D, ils font référence à des Insertions ou des Délétions.
- S'il y a un tiret (–), cela signifie que le génotype n'a pas pu être déterminé pour ce marqueur spécifique.
À quoi sert d'avoir le Raw Data ?
Peut-être te demandes-tu : « Si j'ai déjà mon joli rapport, pourquoi voudrais-je une feuille de calcul géante ? ». Voici trois raisons :
- Transparence totale : Tu as accès à la même information de base que nous.
- Recherche personnelle : Si tu es un utilisateur avancé ou un vétérinaire, tu peux rechercher des variantes spécifiques qui t'intéressent.
- Compatibilité : À ce jour, il n'existe pas d'autres entreprises ou plateformes externes qui permettent le téléchargement et le traitement de fichiers Raw Data de chiens ou de chats. Cependant, compte tenu du rythme auquel le secteur progresse, il est possible que le paysage change et que de nouvelles possibilités émergent à l'avenir, c'est pourquoi, chez Koko Genetics, nous sommes prêts à nous adapter à ce grand saut.
Étape par étape : Comment télécharger le Raw Data de ton animal
Obtenir ce fichier est très simple et totalement gratuit pour les utilisateurs de Koko Genetics. Suis simplement ces étapes :
- Connecte-toi à ton compte Koko Genetics.
- Va dans ton Espace Privé.
- Clique sur la section Paramètres.
- Sélectionne l'option Raw Data.
Un fichier .zip sera automatiquement généré et téléchargé. Il te suffit de le décompresser sur ton ordinateur pour accéder au .csv ou au .txt et visualiser les données.
Pour avoir accès à ce niveau de détail (et à son fichier Raw Data), tu dois d'abord génotyper ton meilleur ami. Notre test ADN pour chiens et chats est la porte d'entrée vers sa biologie.
