In de ‘raw data’ of het Raw Data-bestand worden alle resultaten opgeslagen van de genetische markers die in onze genotyperingschip zijn opgenomen en die in het laboratorium worden gemeten. Het is belangrijk om te begrijpen dat van al deze immense ruwe data slechts een selectie van markers individueel wordt geanalyseerd en gevalideerd om de visuele rapporten van het Koko Genetics-platform te vormen.
U kunt dit bestand gemakkelijk downloaden door naar uw privéaccount te gaan via het pad Instellingen > Ruwe gegevens. Eenmaal gedownload, kunt u eenvoudig zoeken naar het resultaat van specifieke markers (op basis van hun RS-identificatienummer of op basis van hun positie in het genoom) en dit uploaden naar andere genetische interpretatieplatforms. Houd er echter rekening mee dat deze onbewerkte gegevens uitsluitend voor informatieve doeleinden worden verstrekt en nooit mogen worden gebruikt voor medisch of diagnostisch gebruik zonder advies van een dierenarts.
Wanneer u het document opent, ziet u de biologische informatie verdeeld over verschillende technische kolommen. Hieronder leggen we uit hoe u ze allemaal moet interpreteren:
-
ID (identificatie): Het verwijst naar de ID van de sondes die aanwezig zijn in onze technologische array (Axiom™ Canine HD Array). De varianten die in deze sectie worden geanalyseerd, komen overeen met single nucleotide polymorphisms (SNP) en kleine genetische inserties of deleties.
-
Chromosoom: Het geeft het exacte nummer van het chromosoom aan waarop de genetische variant zich bevindt. Honden hebben 38 paar autosomale chromosomen (aangegeven met een getal van 1 tot 38). De geslachtschromosomen worden genoemd met de nummers 39 en 40, terwijl de markers in het mitochondriale DNA worden vermeld met het nummer 42.
-
Positie: Het weerspiegelt de exacte locatie van de genetische marker op basis van ons referentiegenoom, CanFam 3.1.
-
Genotype: Deze kolom bevat de genotyperesultaten van uw huisdier voor elke marker. Genotypes worden weergegeven als paarsgewijze combinaties van de vier DNA-nucleotiden: A, T, G en C. Genetische inserties worden weergegeven door de letter I en deleties door D. Als om een of andere technische reden het genotype van een bepaalde marker niet kan worden bepaald, zal het '–'-symbool verschijnen. Al dit lezen is georiënteerd in Plus volgens het CanFam 3.1-referentiegenoom, van het National Center for Biotechnology Information (NCBI).