Wat is de Raw Data van Koko Genetics? Ontdek wat het onbewerkte DNA-bestand van je huisdier bevat, waar het voor dient en hoe je het vandaag nog gratis kunt downloaden.
Wanneer je de resultaten van Koko Genetics ontvangt, zie je een prachtig rapport, gemakkelijk te begrijpen en vol weetjes over het ras, de kenmerken en de gezondheid van je harige vriend. Maar wist je dat er achter dat rapport een enorme database schuilgaat?
Bij Koko Genetics geloven we dat de genetische informatie van je huisdier van jou is. Daarom stellen we de Raw Data tot je beschikking: het originele en onbewerkte bestand dat rechtstreeks uit ons laboratorium komt.
Wat is een genetische Raw Data precies?
De Raw Data voor honden en katten is een digitaal bestand dat de volledige meting van de genotypering van je huisdier bevat. Zie het als het «negatief» van een foto of de rauwe ingrediënten voordat het uiteindelijke gerecht wordt gekookt.
Dit bestand bevat de informatie van alle genetische markers die aanwezig zijn op de chip (array) die we in het laboratorium gebruiken, niet alleen degene die in je resultatenrapport verschijnen. We hebben het over een massale uitlezing van nucleotiden (de letters van het DNA) precies zoals onze technologie ze detecteert. Omdat het «ruwe» gegevens zijn, zijn ze niet door het interpretatiefilter of de specifieke kwaliteitscontrole gegaan die we toepassen om de gezondheids- en kenmerkenrapporten te genereren. Het is puur technische informatie.
Welke informatie bevat dit bestand?
Wanneer je je Raw Data downloadt, krijg je een bestand in .csv-formaat (gecomprimeerd in een .zip vanwege de grote omvang) met meer dan tienduizenden markers. Elke regel vertegenwoordigt een specifiek punt in het genoom van je huisdier.
Om het als een expert te kunnen interpreteren, is hier de gids om de kolommen van je bestand te begrijpen:
- ID (Probe ID): Het is de identificatie van de probe op onze chip (Axiom Koko Array). Het is als het ware de «technische naam» van die marker.
- Chromosoom: Geeft aan waar die genetische variant leeft.
- Positie: De exacte plaats binnen het chromosoom waar de marker zich bevindt. Hiervoor gebruiken we het referentiegenoom CanFam 3.1 (de huidige wetenschappelijke standaard) voor honden als kaart, en Felis catus_9.0 voor katten.
- Genotype: Hier zit de «kern». Je zult combinaties van twee letters (allelen) zien die A, T, G, C kunnen zijn.
- Als je een I of een D ziet, verwijzen deze naar Inserties of Deleties.
- Als er een streepje (–) verschijnt, betekent dit dat het genotype voor die specifieke marker niet kon worden bepaald.
Waarvoor dient het hebben van de Raw Data?
Misschien vraag je je af: «Als ik mijn mooie rapport al heb, wat moet ik dan met een gigantische spreadsheet?«. Hier zijn drie redenen:
- Volledige transparantie: Je hebt toegang tot dezelfde basisinformatie als wij.
- Eigen onderzoek: Als je een geavanceerde gebruiker of dierenarts bent, kun je zoeken naar specifieke varianten die voor jou van belang zijn.
- Compatibiliteit: Vandaag de dag zijn er geen andere bedrijven of externe platforms die het uploaden en verwerken van Raw Data-bestanden van honden of katten mogelijk maken. Echter, gezien het tempo waarin de sector vordert, is het mogelijk dat het landschap verandert en er in de toekomst nieuwe mogelijkheden ontstaan. Daarom zijn we er bij Koko Genetics op voorbereid om ons aan te passen aan die grote sprong.
Stap voor stap: Hoe de Raw Data van je huisdier te downloaden
Dit bestand in handen krijgen is heel eenvoudig en helemaal gratis voor gebruikers van Koko Genetics. Volg gewoon deze stappen:
- Log in op je Koko Genetics-account.
- Ga naar je Privé-omgeving.
- Klik op de sectie Instellingen.
- Selecteer de optie Raw Data.
Er wordt automatisch een .zip-bestand gegenereerd en gedownload. Je hoeft het alleen maar uit te pakken op je computer om toegang te krijgen tot de .csv of .txt en de gegevens te bekijken.
Om toegang te krijgen tot dit detailniveau (en het Raw Data-bestand), moet je eerst je beste vriend genotyperen. Onze DNA-test voor honden en katten is de toegangspoort tot hun biologie.
