Hva er Koko Genetics rådata? Finn ut hva kjæledyrets rå DNA-fil inneholder, hva den er for, og hvordan du laster den ned gratis i dag.
Når du mottar resultatene fra Koko Genetics, ser du en vakker rapport, lett å forstå og full av nysgjerrigheter om rasen, egenskapene og helsen til din pelskledde venn. Men visste du at bak den rapporten er det en enorm database?
Hos Koko Genetics tror vi at kjæledyrets genetiske informasjon tilhører deg. Av denne grunn stiller vi rådataene til din disposisjon: den originale, ubehandlede filen som kommer direkte fra laboratoriet vårt.
Hva er egentlig genetiske rådata?
Raw Data for hunder og katter er en digital fil som inneholder fullstendig genotyping av kjæledyret ditt. Se for deg det som det "negative" av et fotografi eller råingrediensene før du tilbereder den siste retten.
Denne filen inneholder informasjon om alle de genetiske markørene som finnes på brikken (arrayen) som vi bruker i laboratoriet, ikke bare de som vises i resultatrapporten din. Vi snakker om en massiv lesing av nukleotider (DNA-bokstavene) som detekteres av teknologien vår. Siden de er "rå" data, har de ikke gått gjennom tolkningsfilteret eller spesifikk kvalitetskontroll som vi bruker for å generere helse- og egenskapsrapporter. Det er rent teknisk informasjon.
Hvilken informasjon inneholder denne filen?
Når du laster ned Raw Data, vil du få en fil i .csv-format (komprimert i en .zip på grunn av dens store størrelse) med mer enn titusenvis av markører. Hver linje representerer et spesifikt punkt i kjæledyrets genom.
Slik at du kan tolke det som en ekspert, her er veiledningen for å forstå kolonnene i filen din:
- ID (Probe ID): Det er sondeidentifikatoren på brikken vår (Axiom Koko Array). Det er som det "tekniske navnet" på den markøren.
- Kromosom: Den indikerer hvor den genetiske varianten bor.
- Posisjon: Det nøyaktige stedet i kromosomet der markøren er. For dette brukte vi som kart CanFam 3.1 referansegenomet (den gjeldende vitenskapelige standarden) for hunder, og Felis catus_9.0 for katter.
-
Genotype: Her er "chichaen". Du vil se kombinasjoner av to bokstaver (alleler) som kan være A, T, G, C.
- Hvis du ser en I eller en D, refererer de til innsettinger eller slettinger.
- Hvis en bindestrek (–) vises, betyr det at genotypen ikke kunne bestemmes for den spesifikke markøren.
Hva er hensikten med å ha rådata?
Du lurer kanskje på: «Hvis jeg allerede har den fine rapporten min, hvorfor vil jeg ha et gigantisk regneark?«. Her er tre grunner:
- Full åpenhet: Du har tilgang til samme grunninformasjon som oss.
- Egen forskning: Hvis du er en avansert bruker eller veterinær, kan du søke etter spesifikke varianter som er av interesse for deg.
- Kompatibilitet: Per i dag er det ingen andre selskaper eller eksterne plattformer som tillater opplasting og behandling av Dog eller Cat Raw Data-filer. Men gitt tempoet som sektoren utvikler seg i, er det mulig at panoramaet kan endre seg og nye muligheter kan oppstå i fremtiden, og det er derfor vi i Koko Genetics er forberedt på å tilpasse oss dette store spranget.
Trinn for trinn: Slik laster du ned kjæledyrets rådata
Å få denne filen er veldig enkelt og helt gratis for Koko Genetics-brukere. Bare følg disse trinnene:
- Logg på Koko Genetics-kontoen din.
- Gå til ditt private område.
- Klikk på Innstillinger-delen.
- Velg alternativet Rådata.
En .zip-fil vil automatisk bli generert og lastet ned. Du trenger bare å pakke den ut på datamaskinen for å få tilgang til .csv eller .txt og se dataene.
For å få tilgang til dette detaljnivået (og dens Raw Data-fil), må du først genotype din beste venn. Vår DNA-test for hunder og katter Det er inngangsporten til biologien din.
