Die "Rohdaten" oder die Raw Data-Datei speichern alle im Labor gemessenen Ergebnisse der auf unserem Genotypisierungs-Chip enthaltenen genetischen Marker. Es ist wichtig zu verstehen, dass aus dieser immensen Rohlesung nur eine Auswahl von Markern individuell analysiert und validiert wird, um die visuellen Berichte der Koko Genetics-Plattform zu erstellen.
Sie können diese Datei bequem herunterladen, indem Sie in Ihrem privaten Konto auf Einstellungen > Raw Data zugreifen. Sobald sie heruntergeladen ist, können Sie ganz einfach nach dem Ergebnis bestimmter Marker suchen (sei es nach ihrer RS-Identifikationsnummer oder nach ihrer Position im Genom) und diese auf andere genetische Interpretationsplattformen hochladen. Bitte beachten Sie jedoch, dass diese Rohdaten ausschließlich zu Informationszwecken zur Verfügung gestellt werden und niemals ohne die Beurteilung durch einen Tierarzt für medizinische oder diagnostische Zwecke verwendet werden sollten.
Wenn Sie das Dokument öffnen, sehen Sie die biologischen Informationen in mehreren technischen Spalten angeordnet. Im Folgenden erklären wir, wie jede dieser Spalten zu interpretieren ist:
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ID (Identifikator): Bezieht sich auf die ID der Sonden auf unserem technologischen Array (Axiom™ Canine HD Array). Die in diesem Abschnitt analysierten Varianten entsprechen Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) und kleinen genetischen Insertionen oder Deletionen.
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Chromosom: Gibt die genaue Nummer des Chromosoms an, auf dem sich die genetische Variante befindet. Hunde haben 38 Paar autosomale Chromosomen (die mit einer Zahl von 1 bis 38 angegeben werden). Die Geschlechtschromosomen werden mit den Zahlen 39 und 40 bezeichnet, während die in der mitochondrialen DNA lokalisierten Marker mit der Zahl 42 aufgelistet sind.
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Position: Spiegelt den genauen Ort des genetischen Markers basierend auf unserem Referenzgenom, dem CanFam 3.1, wider.
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Genotyp: Diese Spalte enthält die Ergebnisse des Genotyps Ihres Haustieres für jeden Marker. Die Genotypen werden als Paarkombinationen der vier DNA-Nukleotide A, T, G und C dargestellt. Genetische Insertionen werden durch den Buchstaben I und Deletionen durch den Buchstaben D dargestellt. Wenn der Genotyp eines bestimmten Markers aus technischen Gründen nicht bestimmt werden konnte, erscheint das Symbol „–“. Diese gesamte Auslesung ist Plus-orientiert gemäß dem Referenzgenom CanFam 3.1 des National Center for Biotechnology Information (NCBI).