Czym jest Raw Data od Koko Genetics? Odkryj, co zawiera nieprzetworzony plik DNA Twojego pupila, do czego służy i jak pobrać go za darmo już dziś.
Kiedy otrzymujesz wyniki od Koko Genetics, widzisz estetyczny, łatwy do zrozumienia raport pełen ciekawostek o rasie, cechach i zdrowiu Twojego pupila. Ale czy wiesz, że za tym raportem kryje się ogromna baza danych?
W Koko Genetics wierzymy, że informacja genetyczna Twojego zwierzęcia należy do Ciebie. Dlatego udostępniamy Raw Data: oryginalny, nieprzetworzony plik, który wychodzi bezpośrednio z naszego laboratorium.
Czym dokładnie jest genetyczny Raw Data?
Raw Data dla psów i kotów to plik cyfrowy zawierający pełny odczyt genotypowania Twojego pupila. Wyobraź go sobie jako „negatyw” zdjęcia lub surowe składniki przed przygotowaniem gotowego dania.
Plik ten zawiera informacje o wszystkich markerach genetycznych obecnych na chipie (array), którego używamy w laboratorium — nie tylko o tych, które pojawiają się w Twoim raporcie wyników. Mówimy tu o masowym odczycie nukleotydów (liter DNA) dokładnie tak, jak wykrywa je nasza technologia. Ponieważ są to dane „surowe”, nie przeszły przez filtr interpretacyjny ani specyficzną kontrolę jakości, którą stosujemy przy tworzeniu raportów zdrowotnych i dotyczących cech. To czysto techniczna informacja.
Jakie informacje zawiera ten plik?
Po pobraniu Raw Data otrzymasz plik w formacie .csv (spakowany do .zip ze względu na duży rozmiar), zawierający dziesiątki tysięcy markerów. Każda linia reprezentuje konkretny punkt w genomie Twojego pupila.
Aby móc interpretować go jak ekspert, oto przewodnik po kolumnach w pliku:
ID (Probe ID): To identyfikator sondy w naszym chipie (Axiom Koko Array). To jak „techniczna nazwa” danego markera.
Chromosom: Wskazuje, gdzie znajduje się dana wariant genetyczny.
Pozycja: Dokładne miejsce w obrębie chromosomu, w którym znajduje się marker. W tym celu używamy genomu referencyjnego CanFam 3.1 (aktualny standard naukowy) dla psów oraz Felis catus_9.0 dla kotów.
Genotyp: Tutaj znajduje się sedno informacji. Zobaczysz kombinacje dwóch liter (alleli): A, T, G, C.
Jeśli zobaczysz literę I lub D, oznacza to Insercję lub Delecję.
Jeśli pojawi się myślnik (–), oznacza to, że genotyp nie mógł zostać określony dla danego markera.
Do czego służy Raw Data?
Możesz zapytać: „Skoro mam już ładny raport, po co mi ogromny arkusz kalkulacyjny?”. Oto trzy powody:
Pełna transparentność: Masz dostęp do tych samych danych bazowych, co my.
Własne badania: Jeśli jesteś zaawansowanym użytkownikiem lub lekarzem weterynarii, możesz wyszukiwać konkretne warianty genetyczne, które Cię interesują.
Kompatybilność: Obecnie nie istnieją inne firmy ani zewnętrzne platformy umożliwiające wgrywanie i przetwarzanie plików Raw Data dla psów lub kotów. Jednak biorąc pod uwagę tempo rozwoju branży, sytuacja może się zmienić i w przyszłości mogą pojawić się nowe możliwości — dlatego w Koko Genetics jesteśmy gotowi dostosować się do tego kolejnego kroku.
Krok po kroku: Jak pobrać Raw Data Twojego pupila?
Uzyskanie pliku jest bardzo proste i całkowicie bezpłatne dla użytkowników Koko Genetics. Wystarczy:
Zalogować się na swoje konto Koko Genetics.
Przejść do Strefy Prywatnej.
Kliknąć sekcję Ustawienia.
Wybrać opcję Raw Data.
Plik .zip zostanie automatycznie wygenerowany i pobrany. Wystarczy go rozpakować na komputerze, aby uzyskać dostęp do pliku .csv lub .txt i przeglądać dane.
Aby mieć dostęp do tak szczegółowych informacji (oraz do pliku Raw Data), najpierw musisz przeprowadzić genotypowanie swojego najlepszego przyjaciela. Nasz test DNA dla psów i kotów to brama do poznania jego biologii.
