"Raakatiedot" tai Raw Data -tiedosto tallentavat kaikki genotyypityssirullemme sisällytettyjen ja laboratoriossa mitattujen geneettisten merkkiaineiden tulokset. On tärkeää ymmärtää, että tästä valtavasta raakaluvusta vain osa merkkiaineista analysoidaan ja validoidaan yksilöllisesti Koko Genetics -alustan visuaalisten raporttien muodostamiseksi.
Voit ladata tämän tiedoston kätevästi kirjautumalla yksityiselle tilillesi osiossa Asetukset > Raw Data. Kun tiedosto on ladattu, voit helposti etsiä tiettyjen merkkiaineiden tuloksia (joko niiden RS-tunnistenumeron tai niiden sijainnin perusteella perimässä) ja ladata ne muille geneettisen tulkinnan alustoille. Sinun on kuitenkin pidettävä mielessä, että nämä raakatiedot tarjotaan yksinomaan tiedoksi, eikä niitä tule koskaan käyttää lääketieteellisiin tai diagnostisiin tarkoituksiin ilman eläinlääkärin arviota.
Kun avaat asiakirjan, näet biologisen tiedon jaettuna useisiin teknisiin sarakkeisiin. Alla selitämme, kuinka jokaista niistä tulkitaan:
-
ID (Tunniste): Viittaa teknologisessa matriisissamme (Axiom™ Canine HD Array) olevien koettimien tunnisteeseen. Tässä osiossa analysoidut variantit vastaavat yhden nukleotidin polymorfismeja (SNP) ja pieniä geneettisiä insertioita tai deleetioita.
-
Kromosomi: Ilmaisee kromosomin tarkan numeron, jossa geneettinen variantti sijaitsee. Koirilla on 38 paria autosomeja (jotka on merkitty numeroilla 1-38). Sukupuolikromosomit on nimetty numeroilla 39 ja 40, kun taas mitokondriaalisessa DNA:ssa sijaitsevat merkkiaineet on lueteltu numerolla 42.
-
Sijainti: Heijastaa geneettisen merkkiaineen tarkkaa sijaintia viitegenomimme, CanFam 3.1:n, perusteella.
-
Genotyyppi: Tämä sarake sisältää lemmikkisi genotyypin tulokset kullekin merkkiaineelle. Genotyypit esitetään neljän DNA-nukleotidin (A, T, G ja C) parien yhdistelminä. Geneettiset insertiot on merkitty I-kirjaimella ja deleetiot D-kirjaimella. Jos tietyn merkkiaineen genotyyppiä ei jostain teknisestä syystä pystytty määrittämään, näkyviin tulee symboli '-'. Koko tämä lukema on Plus-suuntainen National Center for Biotechnology Informationin (NCBI) viitegenomin CanFam 3.1 mukaisesti.