Os "dados brutos" ou ficheiro Raw Data armazenam todos os resultados dos marcadores genéticos incluídos no nosso chip de genotipagem que são medidos em laboratório. É importante compreender que, de toda esta imensa leitura bruta, apenas uma seleção de marcadores é analisada e validada individualmente para compor os relatórios visuais da plataforma da Koko Genetics.
Pode descarregar comodamente este ficheiro acedendo à sua conta privada em Definições > Raw Data. Uma vez descarregado, permite-lhe pesquisar facilmente o resultado de marcadores concretos (seja pelo seu número de identificação RS ou pela sua posição no genoma) e carregá-lo noutras plataformas de interpretação genética. Contudo, deve ter em conta que estes dados brutos são oferecidos exclusivamente para fins informativos e nunca devem ser utilizados para uso médico ou diagnóstico sem a avaliação de um profissional veterinário.
Ao abrir o documento, verá a informação biológica distribuída em várias colunas técnicas. Em seguida, explicamos como interpretar cada uma delas:
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ID (Identificador): Refere-se ao ID das sondas presentes no nosso array tecnológico (Axiom™ Canine HD Array). As variantes analisadas nesta secção correspondem aos polimorfismos de um único nucleótido (SNP) e a pequenas inserções ou deleções genéticas.
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Cromossoma: Indica o número exato do cromossoma em que a variante genética está localizada. Os cães têm 38 pares de cromossomas autossómicos (que são indicados com um número de 1 a 38). Os cromossomas sexuais são nomeados com os números 39 e 40, enquanto os marcadores localizados no ADN mitocondrial aparecem listados com o número 42.
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Posição: Reflete a localização exata do marcador genético baseando-se no nosso genoma de referência, o CanFam 3.1.
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Genótipo: Esta coluna contém os resultados do genótipo do seu animal de estimação para cada marcador. Os genótipos são mostrados como combinações de pares dos quatro nucleótidos do ADN: A, T, G e C. As inserções genéticas são representadas com a letra I e as deleções com a D. Se por algum motivo técnico o genótipo de um marcador específico não puder ser determinado, aparecerá o símbolo ‘–‘. Toda esta leitura está orientada em Plus de acordo com o genoma de referência CanFam 3.1, do Centro Nacional para a Informação Biotecnológica (NCBI).