Vad är Koko Genetics Raw Data? Ta reda på vad ditt husdjurs rå DNA-fil innehåller, vad den är till för och hur du laddar ner den gratis idag.
När du får resultaten från Koko Genetics ser du en vacker rapport, lätt att förstå och full av nyfikenhet om din lurviga väns ras, egenskaper och hälsa. Men visste du att det bakom rapporten finns en enorm databas?
På Koko Genetics tror vi att ditt husdjurs genetiska information tillhör dig. Av denna anledning ställer vi rådata till ditt förfogande: den ursprungliga, obearbetade filen som kommer direkt från vårt laboratorium.
Vad exakt är genetiska rådata?
Raw Data för hundar och katter är en digital fil som innehåller den fullständiga genotypningsavläsningen av ditt husdjur. Föreställ dig det som det "negativa" av ett fotografi eller råvarorna innan du lagar den sista rätten.
Den här filen innehåller information om alla genetiska markörer som finns på chipet (arrayen) som vi använder i laboratoriet, inte bara de som visas i din resultatrapport. Vi talar om en massiv läsning av nukleotider (bokstäverna i DNA) som detekteras av vår teknologi. Eftersom den är "rå" data har den inte gått igenom det tolkningsfilter eller den specifika kvalitetskontroll som vi tillämpar för att generera hälso- och egenskapsrapporter. Det är rent teknisk information.
Vilken information innehåller den här filen?
När du laddar ner dina Raw Data får du en fil i .csv-format (komprimerad i en .zip på grund av dess stora storlek) med mer än tiotusentals markörer. Varje linje representerar en specifik punkt i ditt husdjurs arvsmassa.
Så att du kan tolka det som en expert, här är guiden för att förstå kolumnerna i din fil:
- ID (Sond-ID): Det är sondens identifierare på vårt chip (Axiom Koko Array). Det är som det "tekniska namnet" på den markören.
- Kromosom: Det indikerar var den genetiska varianten bor.
- Position: Den exakta platsen i kromosomen där markören är. För detta använde vi CanFam 3.1 referensgenomet (den nuvarande vetenskapliga standarden) för hundar och Felis catus_9.0 för katter som en karta.
-
Genotyp: Här är "chicha". Du kommer att se kombinationer av två bokstäver (alleler) som kan vara A, T, G, C.
- Om du ser ett I eller ett D hänvisar de till Infogningar eller Borttagningar.
- Om ett streck (–) visas betyder det att genotypen inte kunde bestämmas för den specifika markören.
Vad är syftet med att ha rådata?
Du kanske undrar: «Om jag redan har min fina rapport, varför vill jag ha ett gigantiskt kalkylblad?«. Här är tre skäl:
- Full insyn: Du har tillgång till samma basinformation som vi.
- Egen forskning: Om du är en avancerad användare eller veterinär kan du söka efter specifika varianter som är av intresse för dig.
- Kompatibilitet: Från och med idag finns det inga andra företag eller externa plattformar som tillåter uppladdning och bearbetning av hund- eller kattrådatafiler. Men med tanke på den takt som sektorn går framåt i är det möjligt att panoramat kan förändras och nya möjligheter kan uppstå i framtiden, varför vi på Koko Genetics är beredda att anpassa oss till detta stora språng.
Steg för steg: Hur man laddar ner ditt husdjurs rådata
Att få den här filen är väldigt enkelt och helt gratis för Koko Genetics-användare. Följ bara dessa steg:
- Logga in på ditt Koko Genetics-konto.
- Gå till ditt privata område.
- Klicka på avsnittet Inställningar.
- Välj alternativet Raw Data.
En .zip-fil kommer automatiskt att genereras och laddas ner. Du behöver bara packa upp den på din dator för att komma åt .csv eller .txt och se data.
För att komma åt denna detaljnivå (och dess rådatafil) måste du först genotypa din bästa vän. Vår DNA-test för hundar och katter Det är porten till din biologi.
