"Raw data" eller Raw Data-filen lagrar alla resultat av de genetiska markörerna som ingår i vårt genotypningschip som mäts i laboratoriet. Det är viktigt att förstå att av all denna enorma råa läsning är det bara ett urval av markörer som analyseras och valideras individuellt för att bilda de visuella rapporterna från Koko Genetics-plattformen.
Du kan enkelt ladda ner den här filen genom att komma åt ditt privata konto i Inställningar > Raw Data-sökväg. När den väl har laddats ner kan du enkelt söka efter resultatet av specifika markörer (antingen genom deras RS-identifikationsnummer eller genom deras position i genomet) och ladda upp det till andra genetiska tolkningsplattformar. Du bör dock komma ihåg att dessa rådata endast tillhandahålls i informationssyfte och bör aldrig användas för medicinsk eller diagnostisk användning utan råd från en veterinär.
När du öppnar dokumentet ser du den biologiska informationen fördelad i flera tekniska kolumner. Nedan förklarar vi hur man tolkar var och en av dem:
-
ID (identifierare): Det hänvisar till ID för sonderna som finns i vår tekniska array (Axiom™ Canine HD Array). Varianterna som analyseras i detta avsnitt motsvarar singelnukleotidpolymorfismer (SNP) och små genetiska insättningar eller deletioner.
-
Kromosom: Den anger det exakta numret på kromosomen på vilken den genetiska varianten finns. Hundar har 38 par autosomala kromosomer (anges med ett nummer från 1 till 38). Könskromosomerna är namngivna med siffrorna 39 och 40, medan markörerna som finns i mitokondrie-DNA:t är listade med siffran 42.
-
Position: Det återspeglar den exakta platsen för den genetiska markören baserat på vårt referensgenom, CanFam 3.1.
-
Genotyp: Den här kolumnen innehåller ditt husdjurs genotypresultat för varje markör. Genotyper visas som parvisa kombinationer av de fyra DNA-nukleotiderna: A, T, G och C. Genetiska insertioner representeras av bokstaven I och deletioner av D. Om genotypen för en viss markör av någon teknisk anledning inte kunde fastställas, kommer "–"-symbolen att visas. All denna läsning är orienterad i Plus enligt CanFam 3.1 referensgenomet, från National Center for Biotechnology Information (NCBI).