Koko Genetics DNA 検査のすべてのユーザーは、ペットの生データ ファイルを自由に利用できます。これは、唾液サンプルから抽出された DNA から私たちの研究室で生成された、完全に生の遺伝情報を含む非常に貴重なファイルです。
プラットフォーム上にある視覚的なレポートとは異なり、この純粋な読み取り値は、最終分析でどのバリアントが表示されるかをフィルタリングするバイオインフォマティクス品質管理をまだ通過していません。代わりに、ジェノタイピングアレイに存在する何万もの遺伝マーカー、ペットが持つヌクレオチド、およびゲノム内のそれらの正確な位置の完全なリストが含まれています。
ファイルにアクセスして最大限に活用するには、次の手順と技術的な詳細を考慮する必要があります。
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ダウンロード パス: Koko Genetics アカウントにログインし、[プライベート エリア] > [設定] > [生データ] に移動すると、生データを取得できます。
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ファイル形式: 膨大な量の遺伝情報が含まれるため、プラットフォームは .zip 形式の圧縮ファイルを生成します。最終的なドキュメントにアクセスするには、コンピュータで解凍するだけで、.csv または .txt 形式で開きます。
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文書の読み方: ファイルを開くと、情報が列に整理されて表示されます。 3 番目の列は、そのマーカー (またはプローブ ID) が配置されている染色体上の特定の位置を示します。最後の列には、各マーカーに対するペットの遺伝子型が表示されます。これは常に 2 つの対立遺伝子で構成されます (哺乳類は各染色体のコピーを 2 つ持っているため)。
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データの有用性: この生データ ファイルを使用して、チップ上に存在する特定のマーカーについてペットの遺伝子型をご自身で確認することができます。さらに、これは標準形式であるため、このデータをエクスポートして、生ファイルを受け入れる外部遺伝プラットフォームに入力することができます。