В «необработанных данных» или файле необработанных данных хранятся все результаты генетических маркеров, включенных в наш чип для генотипирования, которые измеряются в лаборатории. Важно понимать, что из всего этого огромного количества необработанных данных только отдельные маркеры анализируются и проверяются индивидуально для формирования визуальных отчетов платформы Koko Genetics.
Вы можете легко загрузить этот файл, войдя в свою личную учетную запись в разделе «Настройки» > «Необработанные данные». После загрузки он позволяет легко искать результат по конкретным маркерам (либо по их идентификационному номеру RS, либо по их положению в геноме) и загружать его на другие платформы генетической интерпретации. Однако вы должны иметь в виду, что эти необработанные данные предоставляются только в информационных целях и никогда не должны использоваться в медицинских или диагностических целях без консультации ветеринарного специалиста.
Открыв документ, вы увидите биологическую информацию, распределенную по нескольким техническим столбцам. Ниже мы объясним, как интерпретировать каждый из них:
-
ID (Идентификатор): Это относится к идентификатору датчиков, присутствующих в нашем технологическом массиве (Axiom™ Canine HD Array). Варианты, проанализированные в этом разделе, соответствуют однонуклеотидным полиморфизмам (SNP) и небольшим генетическим вставкам или делециям.
-
Хромосома: Он указывает точный номер хромосомы, на которой расположен генетический вариант. У собак 38 пар аутосомных хромосом (обозначаются цифрами от 1 до 38). Половые хромосомы обозначены номерами 39 и 40, а маркеры, расположенные в митохондриальной ДНК, обозначены номерами 42.
-
Должность: Он отражает точное местоположение генетического маркера на основе нашего эталонного генома CanFam 3.1.
-
Генотип: В этом столбце содержатся результаты генотипа вашего питомца для каждого маркера. Генотипы показаны в виде парных комбинаций четырех нуклеотидов ДНК: A, T, G и C. Генетические вставки обозначаются буквой I, а делеции — буквой D. Если по каким-либо техническим причинам генотип конкретного маркера определить не удалось, появится символ «–». Все это чтение ориентировано в Plus согласно эталонному геному CanFam 3.1 от Национального центра биотехнологической информации (NCBI).