Genetická Raw Data: co jsou, co obsahují a jak je stáhnout u Koko Genetics

Co jsou nezpracovaná data Koko Genetics? Zjistěte, co obsahuje nezpracovaný soubor DNA vašeho domácího mazlíčka, k čemu slouží a jak si jej dnes zdarma stáhnout.

Když obdržíte výsledky od Koko Genetics, uvidíte krásnou zprávu, snadno pochopitelnou a plnou zajímavostí o plemeni, vlastnostech a zdraví vašeho chlupatého přítele. Ale věděli jste, že za touto zprávou je obrovská databáze?

V Koko Genetics věříme, že genetická informace vašeho mazlíčka patří vám. Z tohoto důvodu vám dáváme k dispozici Raw Data: originální, nezpracovaný soubor, který pochází přímo z naší laboratoře.

Co přesně jsou genetická Raw Data?

Raw Data pro psy a kočky je digitální soubor, který obsahuje kompletní genotypizační čtení vašeho mazlíčka. Představte si to jako „negativ“ fotografie nebo surovin před vařením finálního pokrmu.

Tento soubor obsahuje informace o všech genetických markerech přítomných na čipu (pole), které používáme v laboratoři, nejen o těch, které se objevují ve vaší zprávě o výsledcích. Hovoříme o masivním čtení nukleotidů (písmen DNA), jak je detekuje naše technologie. Jelikož se jedná o „surová“ data, neprošla interpretačním filtrem ani specifickou kontrolou kvality, kterou používáme při vytváření zpráv o zdraví a vlastnostech. Jsou to čistě technické informace.

Jaké informace obsahuje tento soubor?

Když si stáhnete nezpracovaná data, získáte soubor ve formátu .csv (komprimovaný do formátu .zip kvůli jeho velké velikosti) s více než desítkami tisíc značek. Každá čára představuje určitý bod v genomu vašeho mazlíčka.

Abyste to mohli interpretovat jako odborník, zde je průvodce k pochopení sloupců vašeho souboru:

1. ID (ID sondy): Je to identifikátor sondy v našem čipu (Axiom Koko Array). Je to jako "technický název" té fixy.
2. Chromozom: Označuje, kde tato genetická varianta žije.
3. Pozice: Přesné místo v chromozomu, kde je značka. K tomu jsme použili jako mapu referenční genom CanFam 3.1 (současný vědecký standard) pro psy a Felis catus_9.0 pro kočky.
4. Genotyp: Tady je „chicha“. Uvidíte kombinace dvou písmen (alel), které mohou být A, T, G, C.
   • Pokud vidíte I nebo D, označují vložení nebo vymazání.
   • Pokud se objeví pomlčka (–), znamená, že genotyp pro tento specifický marker nemohl být určen.

Jaký je účel nezpracovaných dat?

Možná vás zajímá: «Když už mám svou pěknou zprávu, proč chci obří tabulku?«. Zde jsou tři důvody:

• Úplná průhlednost: Máte přístup ke stejným základním informacím jako my.
• Vlastní šetření: Pokud jste pokročilý uživatel nebo veterinář, můžete vyhledávat konkrétní varianty, které vás zajímají.
• Kompatibilita: K dnešnímu dni neexistují žádné jiné společnosti nebo externí platformy, které by umožňovaly nahrávání a zpracování souborů nezpracovaných dat od psů nebo koček. Vzhledem k tempu, kterým sektor postupuje, je však možné, že se panorama může změnit a v budoucnu se mohou objevit nové možnosti, a proto jsme v Koko Genetics připraveni se tomuto velkému skoku přizpůsobit.

Krok za krokem: Jak stáhnout nezpracovaná data vašeho mazlíčka

Získání tohoto souboru je velmi jednoduché a pro uživatele Koko Genetics zcela zdarma. Postupujte podle těchto kroků:

1. Přihlaste se ke svému účtu Koko Genetics.
2. Přejděte do své soukromé oblasti.
3. Klikněte na sekci Nastavení.
4. Vyberte možnost Nezpracovaná data.

Automaticky se vygeneruje a stáhne soubor .zip. Chcete-li získat přístup k souboru .csv nebo .txt a zobrazit data, stačí jej rozbalit v počítači.

Chcete-li získat přístup k této úrovni podrobností (a jejímu souboru nezpracovaných dat), musíte nejprve genotypovat svého nejlepšího přítele. naše Test DNA pro psy a kočky je to brána do vaší biologie.