Všichni uživatelé testu DNA Koko Genetics mají k dispozici soubor Raw Data svého mazlíčka. Jedná se o velmi cenný soubor, který obsahuje zcela nezpracované genetické informace, jak byly vytvořeny v naší laboratoři z DNA extrahované ze vzorku slin.
Na rozdíl od vizuálních zpráv, které najdete na své platformě, toto čisté čtení ještě neprošlo bioinformatickou kontrolou kvality, která filtruje, které varianty se zobrazí v konečných analýzách. Místo toho obsahuje kompletní seznam více než 585 000 genetických markerů přítomných v genotypizačním poli, nukleotidy, které má váš mazlíček, a jejich přesnou polohu v genomu.
Chcete-li získat přístup ke svému souboru a získat z něj maximum, musíte vzít v úvahu následující kroky a technické podrobnosti:
-
Cesta ke stažení: Nezpracovaná data můžete získat tak, že se přihlásíte ke svému účtu Koko Genetics a přejdete do Soukromé oblasti > Nastavení > Nezpracovaná data.
-
Formát souboru: Vzhledem k obrovskému množství genetických informací, které obsahuje, platforma vygeneruje komprimovaný soubor ve formátu .zip. Stačí jej rozbalit v počítači, abyste získali přístup k finálnímu dokumentu, který se otevře ve formátu .csv nebo .txt.
-
Jak číst dokument: Když soubor otevřete, uvidíte informace uspořádané do sloupců. Třetí sloupec vám říká konkrétní pozici na chromozomu, kde se tento marker (nebo ID sondy) nachází. Poslední sloupec zase ukazuje genotyp vašeho mazlíčka pro každý marker, vždy tvořený dvěma alelami (protože savci mají dvě kopie každého chromozomu).
-
Data Utility: Tento soubor nezpracovaných dat můžete použít ke kontrole genotypu vašeho domácího mazlíčka, abyste si sami zkontrolovali jakýkoli specifický marker přítomný na našem čipu. Navíc, jelikož se jedná o standardní formát, umožňuje exportovat a vkládat tato data do externích genetických platforem, které přijímají raw soubory.