Soubor je uspořádán do sloupců. U psů obsahuje:
- ID: identifikátor každé sondy genotypizačního čipu Axiom od Thermo Fisher Scientific. Každá sonda analyzuje SNP nebo malou inserci či deleci.
- Chromozom: psi mají 38 párů autozomů, označených čísly 1 až 38. Pohlavní chromozomy jsou uvedeny jako 39 (X) a 40 (Y), markery mitochondriální DNA jako 42.
- Pozice: poloha markeru v referenčním genomu CanFam 3.1, vytvořeném institutem Broad Institute a dostupném v americkém National Center for Biotechnology Information (NCBI).
- Genotyp: dvě písmena (alely), která má váš mazlíček v daném markeru, jedno pro každou kopii: A, C, G nebo T. Inserce jsou označeny I a delece D. U samců je chromozom X i Y přítomen pouze v jedné kopii a mitochondriální DNA se vyjadřuje jedinou hodnotou. V obou případech může soubor zobrazovat písmeno dvakrát. Pokud marker nebylo možné přečíst, je uvedena pomlčka (-). Genotypy jsou vyjádřeny vzhledem k pozitivnímu vláknu (+) referenčního genomu.
U koček má soubor stejnou strukturu, ale používá kočičí chromozomy a referenční genom.
