Il file "dati grezzi" o file Raw Data memorizza tutti i risultati dei marcatori genetici inclusi nel nostro chip di genotipizzazione che vengono misurati in laboratorio. È importante capire che, di tutta questa immensa lettura grezza, solo una selezione di marcatori viene analizzata e convalidata individualmente per formare i report visivi della piattaforma Koko Genetics.
Puoi scaricare comodamente questo file accedendo al tuo account privato nel percorso Impostazioni > Dati Raw. Una volta scaricato, consente di cercare facilmente il risultato di marcatori specifici (per numero di identificazione RS o per posizione nel genoma) e caricarlo su altre piattaforme di interpretazione genetica. Tuttavia, dovresti tenere presente che questi dati grezzi sono forniti solo a scopo informativo e non dovrebbero mai essere utilizzati per uso medico o diagnostico senza il consiglio di un veterinario.
Quando apri il documento, vedrai le informazioni biologiche distribuite in diverse colonne tecniche. Di seguito spieghiamo come interpretarli:
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ID (Identificatore): Si riferisce all'ID delle sonde presenti nel nostro array tecnologico (Axiom™ Canine HD Array). Le varianti analizzate in questa sezione corrispondono a polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) e piccole inserzioni o delezioni genetiche.
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Cromosoma: Indica il numero esatto del cromosoma su cui si trova la variante genetica. I cani hanno 38 paia di cromosomi autosomici (indicati da un numero da 1 a 38). I cromosomi sessuali sono denominati con i numeri 39 e 40, mentre i marcatori presenti nel DNA mitocondriale sono elencati con il numero 42.
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Posizione: Riflette la posizione esatta del marcatore genetico basato sul nostro genoma di riferimento, CanFam 3.1.
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Genotipo: Questa colonna contiene i risultati del genotipo del tuo animale domestico per ciascun marcatore. I genotipi sono mostrati come combinazioni a coppie dei quattro nucleotidi del DNA: A, T, G e C. Le inserzioni genetiche sono rappresentate dalla lettera I e le delezioni da D. Se per qualche motivo tecnico non è stato possibile determinare il genotipo di un particolare marcatore, apparirà il simbolo '–'. Tutta questa lettura è orientata in Plus secondo il genoma di riferimento CanFam 3.1, del National Center for Biotechnology Information (NCBI).