Что такое необработанные данные Koko Genetics? Узнайте, что содержит файл необработанной ДНК вашего питомца, для чего он нужен и как скачать его бесплатно уже сегодня.
Когда вы получаете результаты от Koko Genetics, вы видите красивый отчет, простой для понимания и полный любопытных сведений о породе, особенностях и здоровье вашего пушистого друга. Но знаете ли вы, что за этим отчетом стоит огромная база данных?
В Koko Genetics мы считаем, что генетическая информация вашего питомца принадлежит вам. По этой причине мы предоставляем в ваше распоряжение необработанные данные: исходный необработанный файл, поступающий непосредственно из нашей лаборатории.
Что такое генетические необработанные данные?
Необработанные данные для собак и кошек — это цифровой файл, содержащий полную информацию о генотипировании вашего питомца. Представьте это как «негатив» фотографии или сырых ингредиентов перед приготовлением конечного блюда.
Этот файл содержит информацию обо всех генетических маркерах, присутствующих на чипе (матрице), которые мы используем в лаборатории, а не только о тех, которые указаны в вашем отчете о результатах. Мы говорим о массовом считывании нуклеотидов (букв ДНК), обнаруженных нашей технологией. Будучи «необработанными» данными, они не прошли фильтр интерпретации или специальный контроль качества, который мы применяем для создания отчетов о состоянии здоровья и характеристиках. Это чисто техническая информация.
Какую информацию содержит этот файл?
Загрузив необработанные данные, вы получите файл в формате .csv (сжатый в .zip из-за его большого размера) с более чем десятками тысяч маркеров. Каждая линия представляет собой определенную точку в геноме вашего питомца.
Чтобы вы могли интерпретировать это как эксперт, вот руководство по пониманию столбцов вашего файла:
- Идентификатор (идентификатор зонда): Это идентификатор зонда на нашем чипе (Axiom Koko Array). Это что-то вроде «технического названия» этого маркера.
- Хромосома: Он указывает, где обитает этот генетический вариант.
- Должность: Точное место в хромосоме, где находится маркер. Для этого мы использовали в качестве карты эталонный геном CanFam 3.1 (текущий научный стандарт) для собак и Felis catus_9.0 для кошек.
-
Генотип: Вот «чича». Вы увидите комбинации двух букв (аллелей), которые могут быть A, T, G, C.
- Если вы видите I или D, они относятся к вставкам или удалениям.
- Если появляется прочерк (–), это означает, что генотип не может быть определен для этого конкретного маркера.
Какова цель использования необработанных данных?
Вам может быть интересно: «Если у меня уже есть хороший отчет, зачем мне огромная таблица?«. Вот три причины:
- Полная прозрачность: У вас есть доступ к той же базовой информации, что и у нас.
- Собственные исследования: Если вы опытный пользователь или ветеринар, вы можете выполнить поиск конкретных вариантов, которые вас интересуют.
- Совместимость: На сегодняшний день нет других компаний или внешних платформ, которые позволяли бы загружать и обрабатывать файлы необработанных данных о собаках или кошках. Однако, учитывая темпы развития отрасли, вполне возможно, что в будущем картина может измениться и могут возникнуть новые возможности, поэтому в Koko Genetics мы готовы адаптироваться к этому большому скачку.
Шаг за шагом: Как загрузить необработанные данные вашего питомца
Получить этот файл очень просто и совершенно бесплатно для пользователей Koko Genetics. Просто выполните следующие действия:
- Войдите в свою учетную запись Koko Genetics.
- Зайдите в свой личный кабинет.
- Нажмите на раздел «Настройки».
- Выберите опцию «Необработанные данные».
ZIP-файл будет создан и загружен автоматически. Вам просто нужно разархивировать его на своем компьютере, чтобы получить доступ к .csv или .txt и просмотреть данные.
Чтобы получить доступ к этому уровню детализации (и к файлу необработанных данных), вам сначала необходимо генотипировать своего лучшего друга. Наш ДНК-тест для собак и кошки Это ворота в вашу биологию.
