Все пользователи ДНК-теста Koko Genetics имеют в своем распоряжении файл необработанных данных своего питомца. Это очень ценный файл, содержащий полностью необработанную генетическую информацию, полученную в нашей лаборатории на основе ДНК, выделенной из образца слюны.
В отличие от визуальных отчетов на вашей платформе, это «сырое» считывание еще не прошло биоинформатический контроль качества, который фильтрует варианты для отображения в итоговых анализах. Вместо этого оно содержит полный список из более чем 585 000 генетических маркеров, присутствующих на микроматрице для генотипирования, нуклеотиды вашего питомца и их точное положение в геноме.
Чтобы получить доступ к файлу и получить от него максимальную пользу, вам просто нужно принять во внимание следующие шаги и технические детали:
-
Путь загрузки: Вы можете получить необработанные данные, войдя в свою учетную запись Koko Genetics и перейдя в «Личный кабинет» > «Настройки» > «Необработанные данные».
-
Формат файла: Из-за огромного количества содержащейся в нем генетической информации платформа сгенерирует сжатый файл в формате .zip. Вам просто нужно разархивировать его на своем компьютере, чтобы получить доступ к окончательному документу, который откроется в формате .csv или .txt.
-
Как читать документ: Открыв файл, вы увидите информацию, организованную в столбцы. В третьем столбце указано конкретное положение на хромосоме, где расположен этот маркер (или идентификатор зонда). Со своей стороны, в последнем столбце показан генотип вашего питомца для каждого маркера, который всегда состоит из двух аллелей (поскольку у млекопитающих есть две копии каждой хромосомы).
-
Полезность данных: Вы можете использовать этот файл необработанных данных, чтобы самостоятельно проверить генотип вашего питомца на наличие любого конкретного маркера, присутствующего на нашем чипе. Более того, поскольку это стандартный формат, он позволяет экспортировать и вводить эти данные во внешние генетические платформы, которые принимают необработанные файлы.