Alle brugere af Koko Genetics DNA-testen har deres kæledyrs rådatafil til deres rådighed. Dette er en meget værdifuld fil, der indeholder fuldstændig rå genetisk information, som genereret i vores laboratorium fra DNA'et ekstraheret fra spytprøven.
I modsætning til de visuelle rapporter, du finder på din platform, har denne råaflæsning endnu ikke gennemgået den bioinformatiske kvalitetskontrol, der filtrerer, hvilke varianter der vises i de endelige analyser. I stedet indeholder den en komplet liste over de mere end 585.000 genetiske markører i genotypningsarrayet, de nukleotider, dit kæledyr bærer, og deres nøjagtige position i genomet.
For at få adgang til din fil og få mest muligt ud af den, skal du blot tage følgende trin og tekniske detaljer i betragtning:
-
Downloadsti: Du kan få dine rådata ved at logge ind på din Koko Genetics-konto og gå til Privat område > Indstillinger > Rådata.
-
Filformat: På grund af den enorme mængde genetisk information, den indeholder, vil platformen generere en komprimeret fil i .zip-format. Du skal blot udpakke det på din computer for at få adgang til det endelige dokument, som åbnes i .csv- eller .txt-format.
-
Sådan læser du dokumentet: Når du åbner filen, vil du se oplysningerne organiseret i kolonner. Den tredje kolonne fortæller dig den specifikke position på kromosomet, hvor markøren (eller probe-id'et) er placeret. På sin side viser den sidste kolonne dig dit kæledyrs genotype for hver markør, som altid består af to alleler (da pattedyr har to kopier af hvert kromosom).
-
Dataanvendelighed: Du kan bruge denne rådatafil til selv at kontrollere dit kæledyrs genotype for en hvilken som helst specifik markør på vores chip. Desuden, da det er et standardformat, giver det dig mulighed for at eksportere og indtaste disse data i eksterne genetiske platforme, der accepterer råfiler.