Hvad er Koko Genetics rådata? Find ud af, hvad dit kæledyrs rå DNA-fil indeholder, hvad den er til, og hvordan du downloader den gratis i dag.
Når du modtager resultaterne fra Koko Genetics, ser du en smuk rapport, let at forstå og fuld af nysgerrighed om din lodne vens race, egenskaber og helbred. Men vidste du, at der bag den rapport er en enorm database?
Hos Koko Genetics tror vi på, at dit kæledyrs genetiske information tilhører dig. Af denne grund stiller vi rådataene til din rådighed: den originale, ubehandlede fil, der kommer direkte fra vores laboratorium.
Hvad er genetiske rådata præcist?
Rådata til hunde og katte er en digital fil, der indeholder den komplette genotypeaflæsning af dit kæledyr. Forestil dig det som det "negative" af et fotografi eller de rå ingredienser, før du tilbereder den sidste ret.
Denne fil indeholder oplysninger om alle de genetiske markører, der findes på den chip (array), som vi bruger i laboratoriet, ikke kun dem, der vises i din resultatrapport. Vi taler om en massiv læsning af nukleotider (bogstaverne i DNA), som detekteres af vores teknologi. Da de er "rå" data, har de ikke været igennem det fortolkningsfilter eller den specifikke kvalitetskontrol, som vi anvender for at generere sundheds- og egenskabsrapporter. Det er rent teknisk information.
Hvilke oplysninger indeholder denne fil?
Når du downloader dine rådata, får du en fil i .csv-format (komprimeret i en .zip på grund af dens store størrelse) med mere end titusindvis af markører. Hver linje repræsenterer et specifikt punkt i dit kæledyrs genom.
For at du kan fortolke det som en ekspert, er her guiden til at forstå kolonnerne i din fil:
- ID (Probe ID): Det er sondeidentifikationen på vores chip (Axiom Koko Array). Det er ligesom det "tekniske navn" på den markør.
- Kromosom: Det angiver, hvor den genetiske variant bor.
- Stilling: Det nøjagtige sted i kromosomet, hvor markøren er. Til dette brugte vi som et kort CanFam 3.1 referencegenomet (den nuværende videnskabelige standard) for hunde og Felis catus_9.0 for katte.
-
Genotype: Her er "chichaen". Du vil se kombinationer af to bogstaver (alleler), der kan være A, T, G, C.
- Hvis du ser et I eller D, henviser de til Indsættelser eller Sletninger.
- Hvis der vises en bindestreg (–), betyder det, at genotypen ikke kunne bestemmes for den specifikke markør.
Hvad er formålet med at have rådata?
Du undrer dig måske: «Hvis jeg allerede har min fine rapport, hvorfor vil jeg så have et kæmpe regneark?«. Her er tre grunde:
- Fuld gennemsigtighed: Du har adgang til de samme basisoplysninger som os.
- Egen forskning: Hvis du er en avanceret bruger eller dyrlæge, kan du søge efter specifikke varianter, der er interessante for dig.
- Kompatibilitet: I dag er der ingen andre virksomheder eller eksterne platforme, der tillader upload og behandling af hunde- eller katte-datafiler. Men i betragtning af det tempo, hvormed sektoren udvikler sig, er det muligt, at panoramaet kan ændre sig, og nye muligheder kan opstå i fremtiden, hvorfor vi hos Koko Genetics er parate til at tilpasse os dette store spring.
Trin for trin: Sådan downloader du dit kæledyrs rådata
At få denne fil er meget enkel og helt gratis for Koko Genetics-brugere. Bare følg disse trin:
- Log ind på din Koko Genetics-konto.
- Gå til dit private område.
- Klik på afsnittet Indstillinger.
- Vælg indstillingen Raw Data.
En .zip-fil vil automatisk blive genereret og downloadet. Du skal bare udpakke den på din computer for at få adgang til .csv eller .txt og se dataene.
For at få adgang til dette detaljeringsniveau (og dens Raw Data-fil) skal du først genotype din bedste ven. Vores DNA-test til hunde og katte Det er porten til din biologi.
