Tutti gli utenti del test del DNA Koko Genetics hanno a loro disposizione il file dei dati grezzi del loro animale domestico. Si tratta di un file molto prezioso che contiene informazioni genetiche completamente grezze, generate nel nostro laboratorio dal DNA estratto dal campione di saliva.
A differenza dei report visivi che trovi sulla tua piattaforma, questa lettura pura non è ancora passata attraverso il controllo di qualità bioinformatico che filtra quali varianti vengono mostrate nelle analisi finali. Include invece un elenco completo delle decine di migliaia di marcatori genetici presenti nell'array di genotipizzazione, dei nucleotidi del tuo animale domestico e della loro esatta posizione nel genoma.
Per accedere al tuo file e trarne il massimo, devi solo prendere in considerazione i seguenti passaggi e dettagli tecnici:
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Percorso di download: Puoi ottenere i tuoi dati grezzi accedendo al tuo account Koko Genetics e andando su Area privata > Impostazioni > Dati grezzi.
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Formato file: A causa dell'enorme quantità di informazioni genetiche che contiene, la piattaforma genererà un file compresso in formato .zip. Devi solo decomprimerlo sul tuo computer per accedere al documento finale, che si aprirà in formato .csv o .txt.
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Come leggere il documento: Quando apri il file, vedrai le informazioni organizzate in colonne. La terza colonna indica la posizione specifica sul cromosoma in cui si trova quel marcatore (o l'ID della sonda). D'altra parte, l'ultima colonna mostra per ogni marcatore il genotipo del tuo animale, sempre composto da due alleli (poiché i mammiferi hanno due copie di ciascun cromosoma).
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Utilità dei dati: Puoi utilizzare questo file di dati grezzi per verificare tu stesso il genotipo del tuo animale domestico per eventuali marcatori specifici presenti sul nostro chip. Inoltre, trattandosi di un formato standard, consente di esportare e inserire questi dati in piattaforme genetiche esterne che accettano file grezzi.