Che cos’è il Raw Data di Koko Genetics? Scopri cosa contiene il file del DNA grezzo del tuo animale, a cosa serve e come scaricarlo gratuitamente oggi stesso.
Quando ricevi i risultati di Koko Genetics, vedi un report bellissimo, facile da capire e pieno di curiosità su razza, tratti e salute del tuo peloso. Ma lo sapevi che dietro quel report c’è un’immensa base di dati?
In Koko Genetics crediamo che le informazioni genetiche del tuo animale ti appartengano. Per questo mettiamo a tua disposizione il Raw Data: il file originale e non elaborato che esce direttamente dal nostro laboratorio.
Che cos’è esattamente un Raw Data genetico?
Il Raw Data per cani e gatti è un file digitale che contiene la lettura completa del genotipaggio del tuo animale. Immaginalo come il “negativo” di una fotografia o gli ingredienti grezzi prima di cucinare il piatto finale.
Questo file include le informazioni di tutti i marcatori genetici presenti nel chip (array) che utilizziamo in laboratorio, non solo quelli che compaiono nel tuo report dei risultati. Parliamo di una lettura massiva di nucleotidi (le lettere del DNA) così come vengono rilevati dalla nostra tecnologia. Essendo dati “grezzi”, non sono passati attraverso il filtro di interpretazione né attraverso lo specifico controllo qualità che applichiamo per generare i report su salute e tratti. È informazione puramente tecnica.
Che informazioni contiene questo file?
Scaricando il tuo Raw Data, otterrai un file in formato .csv (compresso in un .zip a causa delle sue grandi dimensioni) con più di decine di migliaia di marcatori. Ogni riga rappresenta un punto specifico del genoma del tuo animale.
Per aiutarti a interpretarlo come un esperto, ecco la guida per capire le colonne del tuo file:
ID (Probe ID): è l’identificatore della sonda nel nostro chip (Axiom Koko Array). È come il “nome tecnico” di quel marcatore.
Cromosoma: indica dove si trova quella variante genetica.
Posizione: il punto esatto all’interno del cromosoma in cui si trova il marcatore. Per questo utilizziamo come mappa il genoma di riferimento CanFam 3.1 (lo standard scientifico attuale) per i cani e Felis catus_9.0 per i gatti.
Genotipo: qui c’è il “cuore” del dato. Vedrai combinazioni di due lettere (alleli) che possono essere A, T, G, C.
Se vedi una I o una D, si riferiscono a Inserzioni o Delezioni.
Se compare un trattino (–), significa che il genotipo non è stato determinato per quel marcatore specifico.
A che cosa serve avere il Raw Data?
Forse ti chiedi: “Se ho già il mio bel report, perché dovrei volere un enorme foglio di calcolo?”. Ecco tre ragioni:
Trasparenza totale: hai accesso alla stessa informazione di base che abbiamo noi.
Ricerca personale: se sei un utente avanzato o un veterinario, puoi cercare varianti specifiche di tuo interesse.
Compatibilità: ad oggi, non esistono altre aziende o piattaforme esterne che permettano il caricamento e l’elaborazione di file Raw Data per cani o gatti. Tuttavia, dato il ritmo con cui avanza il settore, è possibile che lo scenario cambi e che in futuro emergano nuove possibilità; per questo, in Koko Genetics siamo pronti ad adattarci a questo grande salto.
Passo dopo passo: come scaricare il Raw Data del tuo animale
Ottenere questo file è molto semplice e totalmente gratuito per gli utenti Koko Genetics. Segui questi passaggi:
Accedi al tuo account Koko Genetics.
Vai alla tua Area Privata.
Clicca sulla sezione Impostazioni.
Seleziona l’opzione Raw Data.
In automatico verrà generato e scaricato un file .zip. Ti basterà decomprimerlo sul tuo computer per accedere al .csv o .txt e visualizzare i dati.
Per avere accesso a questo livello di dettaglio (e al suo file Raw Data), prima devi genotipizzare il tuo migliore amico. Il nostro test del DNA per cani e gatti è la porta d’ingresso alla sua biologia.
