生の遺伝データ: その内容、その内容、および Koko Genetics でのダウンロード方法

Koko Genetics の生データとは何ですか?あなたのペットの生の DNA ファイルに含まれる内容、その目的、そして今すぐ無料でダウンロードする方法をご確認ください。

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Raw Data Genético: Qué es, qué contiene y cómo descargarlo en Koko Genetics

Koko Genetics の生データとは何ですか?あなたのペットの生の DNA ファイルに含まれる内容、その目的、そして今すぐ無料でダウンロードする方法をご確認ください。

Koko Genetics から結果を受け取ると、理解しやすく、毛皮で覆われた友人の品種、特性、健康状態についての好奇心が満載の美しいレポートが表示されます。しかし、そのレポートの裏には膨大なデータベースがあることをご存知ですか?

Koko Genetics では、あなたのペットの遺伝情報はあなたのものであると信じています。このため、私たちは生データ、つまり私たちの研究室から直接提供された未処理のオリジナルのファイルを自由に使えるようにしています。

遺伝子生データとは一体何ですか?

犬と猫の生データは、ペットの完全な遺伝子型解析結果が含まれるデジタル ファイルです。それを、写真や最終料理を調理する前の原材料の「ネガ」として想像してください。

このファイルには、結果レポートに表示される遺伝子マーカーだけでなく、研究室で使用するチップ (アレイ) 上に存在するすべての遺伝子マーカーに関する情報が含まれています。私たちは、私たちのテクノロジーによって検出されるヌクレオチド (DNA の文字) の大量の読み取りについて話しています。 「生」データであるため、健康状態および特性レポートを生成するために適用される解釈フィルターや特定の品質管理は行われていません。それは純粋に技術的な情報です。

このファイルにはどのような情報が含まれていますか?

Raw データをダウンロードすると、数万を超えるマーカーを含む .csv 形式のファイル (サイズが大きいため .zip で圧縮) が得られます。各線はペットのゲノム内の特定の点を表します。

専門家のように解釈できるように、ファイルの列を理解するためのガイドを以下に示します。

  1. ID (プローブ ID): これは、チップ (Axiom Koko Array) 上のプローブ識別子です。そのマーカーの「技術名」のようなものです。
  2. 染色体: それは、その遺伝子変異がどこに存在するかを示します。
  3. 位置: マーカーが存在する染色体内の正確な場所。このために、犬には CanFam 3.1 参照ゲノム (現在の科学標準)、猫には Felis catus_9.0 をマップとして使用しました。
  4. 遺伝子型: こちらが「チチャ」。 A、T、G、C となる 2 つの文字 (対立遺伝子) の組み合わせが表示されます。
    • I または D が表示されている場合は、挿入または削除を指します。
    • ダッシュが表示された場合 () は、その特定のマーカーの遺伝子型を決定できなかったことを意味します。

Raw データを取得する目的は何ですか?

あなたはこう疑問に思うかもしれません: «素晴らしいレポートがすでにあるのに、なぜ巨大なスプレッドシートが必要なのでしょうか?«。理由は次の 3 つです。

  • 完全な透明性: あなたは私たちと同じ基本情報にアクセスできます。
  • 独自の研究: 上級ユーザーまたは獣医師の場合は、興味のある特定のバリエーションを検索できます。
  • 互換性: 現在のところ、犬や猫の生データ ファイルのアップロードと処理を許可する企業や外部プラットフォームは他にありません。しかし、この分野の進歩のペースを考えると、将来的には状況が変わり、新たな可能性が生まれる可能性もあります。そのため、ココ ジェネティックスでは、この大きな飛躍に適応する準備ができています。

ステップバイステップ: ペットの生データをダウンロードする方法

Koko Genetics ユーザーにとって、このファイルの入手は非常に簡単で完全に無料です。次の手順に従ってください。

  1. Koko Genetics アカウントにログインします。
  2. プライベートエリアに行きます。
  3. 「設定」セクションをクリックします。
  4. [生データ] オプションを選択します。

.zip ファイルが自動的に生成され、ダウンロードされます。コンピューター上で解凍するだけで、.csv または .txt にアクセスしてデータを表示できます。

この詳細レベル (およびその生データ ファイル) にアクセスするには、まず親友の遺伝子型を特定する必要があります。私たちの 犬のDNA検査 そして それはあなたの生物学への入り口です。